Рассмотрена сфера недропользования как элемент региональной эколого-экономической системы. Дан анализ состояния экономических отношений, институциональных основ недропользования. Выявлены основные экономические инструменты регулирования процессов недропользования, оценена эффективность их применения. Определена институциональная база недропользовательской деятельности в Казахстане. Обоснован механизм разрешения региональных интересов в сфере недропользования.