Изучены геномные структуры овец казахстанских двух пород. Разработаны различные способы тестирования популяции двух пород на однородность. Выявлены видоспецифические, породоспецифические фрагменты с различной частотой встречаемости (частота встречаемости в популяции более 0,4). Обнаружены редко встречающиеся фрагменты (с частотой менее 0,4). Сочетания этих фрагментов образуют специфические совокупности ISSR-спектров, благодаря которым формируются генофондные профили породы.