Проведена оценка политики налогового стимулирования в Казахстане. Разработаны меры налогового стимулирования, способствующие ускоренному развитию инновационного сектора в Республике Казахстан. Осуществлен анализ практики налогового администрирования. Предложены рекомендации по совершенствованию системы налогообложения и администрирования налогов в едином экономическом пространстве. Разработана многофакторная экономическая модель влияния механизма налогового стимулирования на развитие инновационного сектора в Карагандинском регионе.