Cобраны вируссодержащие водные образцы из различных водоемов Или-Балхашского региона. Выделены образцы нуклеиновых кислот для метагеномных исследований. Разработана экспериментальная тест-система для определения гена ДНК-полимеразы. Подобраны праймеры, позволяющие получать ампликоны генов-маркеров. Получены качественные библиотеки генов бактериофагов. Метагеномное секвенирование библиотек показало широкое распространение и разнообразие представителей бактериофагов семейств Myoviridae, Siphoviridae и Podoviridae водоемах. Показано, что наибольшее количество вирусных последовательностей содержится в водных образцах, полученных из реки Или и озера Балхаш. Минимальное разнообразие бактериофагов обнаружено в озере около г. Капчагай. Биоразнообразие бактериофагов находится в прямой зависимости от экологического состояния водоема, что создает предпосылки для их использования в качестве биоиндикаторов водных экосистем.