Определены популяции редких и эндемичных видов Шу-Илейских гор и Заилийского Алатау в местах с разной степенью нарушенности растительного покрова. Проанализирован флористический состав сообществ в зависимости от степени нарушенности. Выявлено снижение видового разнообразия при увеличении степени нарушенности растительного покрова. Проведен анализ численности популяций редких и эндемичных видов разных жизненных форм, в т.ч. высокогорного вида Schmalhausenia nidulans. Показано, что численность популяций зависит от площади, занимаемой видом, и типа антропогенных факторов.