Состав микроорганизмов почвенного агроценоза под бобовыми культурами и люцерной в период вегетации представлен комплексом патогенных и сапрофитных видов грибов рода Alternaria, Fusarium, Botrytis, Sclerotinia, Aspergillus, Helminthosporium, Penicillium, Rhizoctonia, Mucor, Cylindrocarpon, Trichoderma. Наибольшей ростостимулирующей активностью обладала 3%-ная культуральная жидкость грибов Trichoderma viride 22 и Trichoderma album 23. Обработка семян 5%-ной и 10%-ной культуральной жидкостью гриба рода Mortierella sp. приводила к стимуляции роста стебля нута, гороха и люцерны. Наибольший выход биомассы гриба на 15 сутки был на фоне минеральной среды Чапека с добавлением шрота и овсянки (в соотношении 1:1). Для штамма гриба Trichoderma viride 22 оптимальной для накопления биомассы была среда сусло-агар, картофельно - глюкозный агар и среда с пептоном, а для штамма Trichoderma album 23 и соевый агар, картофельно- глюкозный и среда с пептоном. Показано, что наибольший спектр ингибирования был у штаммов грибов рода Trichoderma viride 22 и 23 и Trichoderma asperellum 1M, которые подавляли рост всех испытуемых патогенов, зоны ингибирования роста составляли от 40 до 45 мм. Незначительную антагонистическую активность показал гриб рода Mortierella sp. против Botrytis cinerea (12-мм). Проведен подбор питательных сред оптимальных для роста активных грибов, позволивших рекомендовать лучшие среды для накопления биомассы и биосинтеза биологически активных веществ.