Рассмотрено повышение качества знаний обучающихся по трудноусваиваемым предметам, по органической и неорганической химии с применением виртуальной интерактивной визуализации процессов при выполнении практических лабораторных работ на компьютере, повышение качества образования у обучающихся, где слабое материально-техническое снабжение для выполнения лабораторных работ. Исследован вопрос создания виртуальных интерактивных лаборатории с наглядностью глубинных механизмов химических реакций на атомарном уровне по неорганической и органической химии. Найдены алгоритмы определения валентности, количество нейтронов и протонов, а также процесса химической реакции в неорганической химии по 1 и 8 группам таблицы Д.И. Менделеева, а также по группам \"Лантаноиды\", \"Актиноиды\". На основе исследования планируются практические применения результатов виртуально-управляемой (интерактивная) лаборатории с визуализацией и анимацией механизмов протекания процессов, по неорганической и органической химии.