Рассмотрены система обеспечения микробиологической безопасности пищевых продуктов путем разработки и внедрения современных методов микробиологического, молекулярно-генетического анализа и нормативы безопасности на основе изучения особенностей возбудителей эмерджентных пищевых зоонозов. Изучена степень распространенности возбудителей эмерджентных пищевых зоонозов у животных, в продуктах животного происхождения и в обьектах окружающей среды на территории Казахстана, их видовой состав и свойства эмерджентных патогенов. Произведен скрининг возбудителей эмерджентных пищевых инфекций и создан банк данных возбудителей эмерджентных инфекций. Будут разработаны новые методические подходы, позволяющие проводить ускоренную индикацию возбудителя в различных видах пищевых продуктов с использованием высокоспецифичных комбинированных схем бактериологического и молекулярно-генетического анализа на основе подбора наиболее информативных биохимических тестов и их генотипирования с применением ПЦР.