Исследованы природные штаммы микроводорослей. Рассмотрено выделение чистых культур фототрофных микроорганизмов, перспективных для получения биотоплива, изучение их культурально-морфологических и физиологических свойств и оптимизация способов их культивирования. Изучен видовой состав альгофлоры горячих источников Уйгурского района Алматинской области, озера Иссык и озера Биликоль и выделены 15 альгологически чистых культур микроводорослей и цианобактерий относящихся к классу Oscillatoriophycideae и к классу Synechococcophycideae отдела синезеленых водорослей и к классу Chlorophyceae отдела зеленых микроводорослей. Получены бактериологически чистые и идентифицированы по культурально-морфологическим, физиологическим и генетическим признакам 6 культур выделенных штаммов микроводорослей. Установлено, что из выделенных штаммов наиболее высокой продуктивностью прироста биомассы обладали штаммы Chlorella vulgaris sp -1 и Scеnеdеsmus obliquus sp-21. Выявлено, что содержание липидов у выделенных штаммов микроводорослей коррелирует с продуктивностью биомассы. Установлено, что в липидном экстракте выделенных 6 микроводорослей присутствовали как насыщенные, так и ненасыщенные жирные кислоты. В результате анализа жирнокислотного состава определено 18 компонентов, 5 из которых составляют насыщенные жирные кислоты.