Определены основные предпосылки осуществления инновационно-индустриальной модернизации национальной экономики с обоснованием необходимости стратегического управления процессами. Выявлены особенности казахстанского управления модернизацией. Разработаны концептуальные основы стратегического управления процессом с выделением принципов факторно-целевого управления и подходов к его организации. Определены ключевые модули, подсистемы формирования модели инновационно-индустриальной модернизации.