Флора пустынь Или-Балхашского региона включает 933 вида, относящихся к 368 родам и 82 семействам. Преобладающей группой является древнесредиземноморская, включающая туранский, турано-центральноазиатский и ирано-туранский геоэлементы. Обнаружены 56 видов эндемиков. Среди экологических групп растений лидируют ксерофиты (372 вида). Анализ жизненных форм показал преобладание стержнекорневых поликарпиков и монокарпических трав, что является типичным признаком флоры аридных территорий. Подавляющее число видов принадлежит группам гемикриптофитов (457) и терофитов (311). Выявлены 214 видов сорных растений. Зарегистрированы 16 редких и исчезающих видов.