Флора месторождения Косчагыл характеризуется обедненным видовым составом, связанным с антропогенным воздействием. В растительном покрове преобладают ксерофитные полукустарнички. Характерно преобладание биюргуновых и чернополынных сообществ, белоземельнополынников и лерхополынников. Неболее распространены сарсазановые, галофитнолуговые, кустарниковые и шренкиановополынные сообщества. Растительный покров в разной степени трансформирован. На разливах нефти отмечены единичные растения сарсазана, адраспана, жантака и однолетних солянок. Разработана классификация экосистем месторождения Косчагыл. Проведено разделение экосистем на природные и антропогенно-нарушенные.