Идентифицированы сорта подсолнечника казахстанской селекции, выявлена степень их полиморфности. Разработан способ оценки типичности и чистоты самоопыленных линий и уровня гибридности F1 семян подсолнечника. Проведена биохимическая оценка самоопыленных линий, гибридов и сортов подсолнечника по масличности, содержанию белка, свободного пролина. Отмечена обратная взаимосвязь продолжительности вегетационного периода и уровня свободного пролина в семенах. Последний может служить биохимическим маркером в селекции подсолнечника на скороспелость и показатели урожайности. Цитоплазматические белки также можно использовать в определении уровня гибридности семян подсолнечника. Составлены белковые формулы простых гибридов Казахстанский 1 и Казахстанский 5, а также их родительских форм. Оценена активность фермента пероксидазы проростков. Отмечена перспективность использования относительной активности отдельных изоформ в прогнозировании болезнеустойчивости линий и гибридов подсолнечника.