Проведено комплексное морфологическое исследование органов пищеварительной, дыхательной, выделительной и воспроизводительной систем и периферической крови фоновых видов амфибий и рептилий, обитающих в Или-Балхашском бассейне. Выявлены изменения реактивно-адаптационного характера. Биотопы мест обитания расценены как малозагрязненные. Наименьшие повреждения отмечены у животных, обитающих в районе артезианской скважины вблизи Капчагайского водохранилища. Район накопителя Сорбулак характеризуется как сильно загрязненная экосистема. У амфибий и рептилий данной экосистемы наблюдаются выраженные патологические процессы во всех исследованных органах, коррелирующие с изменениями в крови.