Разработана математическая модель пространственного турбулентного течения в стратифицированной атмосфере. Оценено возмущение приземного слоя атмосферы. Математическая модель включает в себя систему уравнений динамики атмосферы, записанную в изобарической системе координат, уравнения сохранения массы, турбулентного переноса тепла и концентрации компонентов газов средней атмосферы. Для решения уравнения движения применен метод расщепления по физическим параметрам. Создан программный комплекс для моделирования динамических процессов в средней атмосфере. Проведены тестовые расчеты реальных данных.