Реферат: Изучены взаимодействия 749 miRNA генома Bos taurus с mRNA 20 генов транскрипционных факторов семейства MYB. Установлены сайты связывания 58 miRNA с mRNA восьми генов семейства MYB. В mRNA каждого из генов выявлено от трех сайтов связывания для гена MYBL1 до 21 сайта связывания для гена NCOR1. MiR-1260b имела сайты связывания в мRNA генов MIER1, NCOR1, RCOR1. Девять miRNA имели сайты связывания в mRNA двух генов. Величина G/Gm, характеризующая степень сродства miRNA к mRNA, изменялась от 85 до 90%. Обсуждается роль bta-miRNA в регуляции экспрессии генов-мишеней транскрипционных факторов семейства MYB.
Дала жағдайында стевияның өсiп-даму ерекшелiгi мен өсiмдiк жапырағындағы гликозидтердiң жинақталу заңдылығы
Автор(ы): Асрандина С. Ш.*Кенжебаева Ш.*Атабаева С. Д.*Кударов Б. Р.*Алиева Т. Қ.*Рақыш Қ.*
Объем документа: С. 9-12
МРНТИ: 34.31.27*
Ключевые слова: полевое условие*
Реферат: В статье приведены результаты по изучению особенностей роста и развития стевии в полевых условиях, а также закономерности накопления гликозидов в листьях стевии. Выявлено, что рост и развитие и накопления гликозидов в листьях стевии зависит от экологических условий и от вида линий (широколистная, узколистная и оваловидная) стевии. Общее накопления суммы гликозидов составило 19-22,5 %, а сумма стевиозида 7,5-9%. При сравнении линий между собой, сумма гликозидов и стевиозида была выше в листьях у широколистной стевии, среднее значение у узколистной, значительно ниже у овололистной стевии.
Взаимодействие miRNA семейства miR-1273 с mRNA генов, регулирующих клеточный цикл и апоптоз
Автор(ы): Атамбаева Ш. А.*Ниязова Р. Е.*Иващенко А. Т.*
Реферат: Показано, что гены, участвующие в регуляции клеточного цикла и апоптоза, являются мишенями для семей┐ства miR-1273. Гены ATM, TP53 и VHL регулируют как клеточный цикл, так и апоптоз. Их mRNA имеют сайты связывания с miRNA семейства miR-1273. Гены CLSPN, MDM2, NF2, TRIM13 и LZTS1 участвуют в регуляции клеточного цикла и их mRNA тоже являются мишенями для большинства изученных miRNA. Гены SPN, CASP, STK4 и DFFB участвуют в регуляции апоптоза и служат мишенями для семейства miRNA-1273. Изученные miRNA при соответствующих концентрациях могут сильно влиять на экспрессию генов, участвующих в регу┐ляции клеточного цикла и апоптоза.
Взаимодействие miRNA с mRNA генов транскрипционных факторов семейства MYB арабидопсиса
Автор(ы): Бари А. А.*Иващенко А. Т.*Пинский И. В.*Сагайдак А. И.*Оразова С. Б.*
Реферат: Установлены сайты связывания 40 miRNA с mRNA генов семейства MYB арабидопсиса. Для miR828 и miR858 имеется 14 и 13 генов-мишеней, соответственно. Мишенями miR5021 и miR5658 являются 16 и 20 генов семейства, соответственно. В их mRNAвыявлены множественные сайты связывания, начала которых локализованы последовательно через 1-3 нуклеотида. Семейства miR159 и miR319 имеют общие сайты связывания в mRNA шести генах MYB. 26 miRNA имеют по одному сайту связывания в mRNA 23 генов MYB. Все сайты связывания miRNA локализованы в белок кодирующей области mRNA генов-мишеней. Нуклеотидные после┐довательности сайтов связывания каждой miRNA гомологичны и кодируют гомологичные олигопептиды.
Сайты связывания miRNA-маркеров рака молочной железы
Автор(ы): Берилло О. А.*Ренье М.*
Объем документа: С. 23-26
МРНТИ: 34.23.17*
Ключевые слова: молочная железа*раковая клетка*
Реферат: 1300 абстрактов статей, посвященных поиску маркерных miRNA для диагностики рака молочной железы, обработаны с помощью скрипта miRCancer. Проведен поиск сайтов связывания 357 miRNA в mRNA 427 генов, белки которых участвуют в онкогенезе молочной железы. Используя программу MirTarget отобраны сайты связывания miRNA в 5 UTR, CDS, 3\'UTR mRNA со свободной энергией гибридизации равной 90% и более. Нами выявлено, что miR-665 и miR-4417 являются перспективными маркерами для диагностики рака молочной железы.
Реферат: С использованием tBLASTn поисковой системы базы данных NCBI по гомологии к АП-эндонуклеазе человека и арабидопсиса идентифицирован ген, кодирующий предполагаемую АП-эндонуклеазу Triticum aestivum (ТаАpe1L). Осуществлена функциональная экспрессия TaAPE1L с гистидиновым концом в E. coli и очищена. С использованием 5\'-[P32] - меченных олигонуклеотидных дуплексов, содержащих единственный тетрагидро┐фуран - аналог АП сайта, показано TaApe1L проявляет cлабую AП-эндонуклеазную и 3\' 5\' экзонуклеазную активность и предпочитает Mn2+ в качестве кофактора. Также показано, что увеличение времени инкубации сопровождается повышением активности фермента и добавление в реакционную смесь хелатора двухвалентных ионов - ЭДТА полностью подавляет АП-эндонуклеазную активность TaApe1L.
Выявление влияния мТОР комплекса на транспорт рибосомальных белков при питательном истощении
Реферат: Синтез рибосомальных белков контролируется взаимодействием множества сигнальных систем в клетке. Роль мТОР комплекса в биосинтезе рибосомальных белков заключается в координации нуклео-цитоплазматического транспорта зависимого от наличия питательных веществ и ко-факторов. В данной работе показано понижение содержания рибосомальных белков rpS3 и rpL26 в ядерной фракции при субклеточном фракционировании. Также при проведении аминокислотного истощения в клетках MEF Rictor-/- замечена одинаковая регуляция как и при диком типе линии клеток MEF, что исключает участие мТОР комплекса 2 при транспорте белков в ядро. Характер снижения уровня белков в ядерной фракции свидетельствует о стабильной регуляции транспорта белков путем протеинкиназной сигнальной системы мТОР комплекса.
RAPD-фингерпринтинг почвенных микромицетов
Автор(ы): Ли К. Г.*Молдагулова А. К.*Бекенова Э. Е.*Кажыбаев А. К.*Каирова М. Ж.*Уразова М. С.*Шайхин С. М.*Алмагамбетов К. Х.*
Реферат: Нами получены стабильные RAPD-профили для 7 изолятов почвенных микромицетов амплификацией геномной ДНК с одиночными неспецифическими праймерами. В ПЦР были применены произвольный праймер (декамер АР3), праймер-производное от межгенного спейсерного региона (Т3В) и микросателлитный праймер (GTG)3. Четкие и воспроизводимые профили продуктов амплификации были получены для всех 7 изолятов микромицетов. Количество и размеры ампликонов имели выраженную видовую специфичность. В некоторых случаях наблюдалась и внутривидовая вариабельность. Результаты показывают оправданность применения ДНК-фингерпринтинга для маркирования и быстрой идентификации почвенных микромицетов, а также оцен┐ки их стабильности при длительном культивировании.
Реферат: Пептидогликангидролазы играют важную роль в делении клеток лактобацилл, и, вместе с тем, оказывают существенное влияние на иммунный статус колонизируемых ими организмов. Гены, кодирующие пептидогликангидролазы Lactobacillus rhamnosus GG p40 и p75 и их гомологи, представляют интерес как объекты клонирования с целью усиления их экспрессии в гомо- и гетерологичном окружении. Последовательности гомологов p40 и p75 из штаммов Lactobacillus rhamnosus BSR и Lactobacillus casei BIОО5 были онаружены с помощью специфичных праймеров, а продукты их амплификации клонированы в векторе pGEMR-T Easy. Полученные плазмидные конструкции будут использованы для дальнейших манипуляций по изучению экспрессии генов пептидогликангидролаз в клетках E.coli.
Множественные сайты связывания некоторых miRNA в mRNA генов человека
Автор(ы): Ниязова Р. Е.*Атамбаева Ш. А.*Берилло О. А.*Пыркова А. Ю.*Иващенко А. Т.*
Реферат: Установлена структурная организация сайтов связывания miR-3960, miR-3620-5p и miR-8072 в mRNA генов человека. Выявлены участки mRNA в которых последовательно через 1-3 нуклеотидов локализованы несколько сайтов связывания miR-3960. Нуклеотидные последовательности этих участков в CDS кодируют полиаланин или полипролин. В 5\'UTR и 3\'UTR структурная организация сайтов связывания miRNA идентична таковой в CDS. Показано, что miR-3960, miR-3620-5p и miR-8072 могут связываться с генами, участвующими в регуляции клеточного цикла и апоптоза. Обсуждаются свойства miR-3960, miR-3620-5p и miR-8072 и их роль в раз-витии онкологических заболеваний.
